据台媒报道，王建煊也相信马英九绝对不会干扰“监院”办案，否则“监院”真的“只是拿钱吃饭”。对于上任后是否将先办巴布亚新几内亚案、鐽震案，王建煊7日晚接受陈文茜专访时态度稍有保留，他指出，如果有些弊案目前已经进入司法程序，“监察院”其实就不便调查，但“监院”若认为可以查，也不是不合法，主要是办案时需要证据，就可能要和司法机关协调，司法若说不方便，“监院”要找证据就很困难。

　　未来“监察院”办案 谁都休想干扰

　　不过王建煊说，现在要办的一定是旧案，后面等到的则一定是国民党执政后的案子，像是最近有关苏花高的争议，他虽然还不了解，但在大原则上，他认为应该要经过环境评估才可以，如果找个理由跳过，那“监察院”应该可以发挥一点“小的”力量。对于陈文茜质疑如果“行政院长”刘兆玄有问题要不要放？王建煊大声回说，“放了以后怎么办？这个放那个放怎么做？”

　　至于陈文茜问到王建煊的夫人曾说“我觉得有使命感的人很可怜”，王建煊谈到此突然哽咽说不出话来，眼眶含着泪，吞了一口气说“我觉得对”，我觉得要对台湾做点事。

　　王建煊:现在要办的一定是旧案

　　对于“立法院”审核他“监院院长”资格时的质疑，王建煊不讳言，他心里虽想“你算老几”，但民主政治就是这样。王建煊也打包票说，他自己对台湾贡献绝对比陈水扁这些人大很多，“我们做公务员的时候每天都在为台湾做事，我们选举经费全部捐出来，没像他们把选举经费放在自己口袋里。”